30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3460 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  75.62 
 
 		 669 aa  980    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1301    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  98.03 
 
 		 764 aa  1270    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  38.63 
 
 		 690 aa  356  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  34.07 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  21.56 
 
 		 655 aa  77  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 789 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  26.67 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  38.24 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  25.74 
 
 		 747 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  22.6 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  32.04 
 
 		 662 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.05 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  22.08 
 
 		 728 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.26 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  26.86 
 
 		 737 aa  50.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  22.93 
 
 		 1249 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  30.1 
 
 		 648 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  20.96 
 
 		 588 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  32 
 
 		 675 aa  48.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  35.16 
 
 		 693 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  22.69 
 
 		 672 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  34.15 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  22.19 
 
 		 614 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  22.19 
 
 		 614 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  23.35 
 
 		 649 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  34.34 
 
 		 651 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  27.49 
 
 		 660 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  27.49 
 
 		 660 aa  44.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  34.62 
 
 		 615 aa  44.3  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>