More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2455 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  99.55 
 
 		 441 aa  888    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  74.32 
 
 		 441 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  94.1 
 
 		 441 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  80.23 
 
 		 441 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  69.89 
 
 		 449 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 		 440 aa  609  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  47.71 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.97 
 
 		 458 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  34.07 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 469 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 469 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 508 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 482 aa  246  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 477 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 465 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 469 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 481 aa  232  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0950  glutamyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 466 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0737  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.578074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 504 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 475 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.07 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>