53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2439 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  96.5 
 
 		 200 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  57.84 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  50.5 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  55.17 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  40.8 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  48.82 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  42.03 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  40.1 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  41.89 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  42.69 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  40.81 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  41.78 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  47.73 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  39.19 
 
 		 289 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  34.6 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  39.89 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  39.29 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  40.43 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  36.52 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  39.74 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  39.65 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  39.57 
 
 		 230 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  40.53 
 
 		 231 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  38.32 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  38.29 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  38.74 
 
 		 264 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  38.74 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  38.5 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  36.93 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  37.84 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  32.88 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  33.87 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  38.04 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  43.24 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  37.01 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  29.14 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  34.5 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  32.84 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  34.06 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  42.25 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  41.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  36.49 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5302  hypothetical protein  38.89 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  41.2  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  33.03 
 
 		 262 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>