142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4402 on replicon NC_009433
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  50.96 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  43.75 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  46.86 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  37.44 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  34.58 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.37 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  28.67 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.93 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  25.23 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.05 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  24.38 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.38 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.63 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  27.04 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.53 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.53 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  26.02 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  26.05 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.85 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.31 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.31 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  23.79 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.3 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.68 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.27 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.77 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.62 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.12 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.46 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.43 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  29.03 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  21.86 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  31.2 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  22.58 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  30.56 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.96 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.19 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.07 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  23.65 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>