31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2450 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  59.36 
 
 		 368 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  38.21 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  36.14 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  77.42 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  78.38 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  39.02 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0731  hypothetical protein  87.18 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.350901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  55.26 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  37.18 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  43.59 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  47.37 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  48.48 
 
 		 605 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  48.48 
 
 		 610 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  35.14 
 
 		 1163 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  35.14 
 
 		 1144 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  48.48 
 
 		 479 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  41.03 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  43.75 
 
 		 571 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  32.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  31.65 
 
 		 1244 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  27.38 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  36.11 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  32.56 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  36.11 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  32.2 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  45.45 
 
 		 297 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 		 538 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>