More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1836 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  73.63 
 
 		 296 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  73.63 
 
 		 296 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  73.63 
 
 		 296 aa  143  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  69.23 
 
 		 236 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  67.03 
 
 		 293 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  67.03 
 
 		 276 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  68.13 
 
 		 239 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  65.93 
 
 		 290 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  65.93 
 
 		 290 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  67.03 
 
 		 245 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  63.74 
 
 		 217 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  63.74 
 
 		 233 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  63.74 
 
 		 233 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  63.74 
 
 		 208 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  63.74 
 
 		 191 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  63.74 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  62.64 
 
 		 233 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  61.54 
 
 		 278 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  58.24 
 
 		 275 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  60.44 
 
 		 275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  59.34 
 
 		 257 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  60.44 
 
 		 275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  59.34 
 
 		 275 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  62.79 
 
 		 172 aa  123  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 276 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6988  Integrase catalytic region  58.24 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  60.23 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  60.23 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  59.09 
 
 		 307 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 		 262 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 		 262 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 		 262 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 		 262 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  59.09 
 
 		 288 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  56.52 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  56.52 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  56.52 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  56.52 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 307 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 307 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 306 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 258 aa  116  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  59.34 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 325 aa  114  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  58.24 
 
 		 280 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  52.75 
 
 		 276 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  48.35 
 
 		 278 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  50.55 
 
 		 276 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 279 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 279 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  52.17 
 
 		 279 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3028  integrase catalytic subunit  54.32 
 
 		 245 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  47.25 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  46.07 
 
 		 290 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  50 
 
 		 279 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2620  hypothetical protein  52.94 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.452433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  43.96 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1412  Integrase catalytic region  40.66 
 
 		 253 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000825692  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2501  hypothetical protein  55.88 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.990721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 369 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 369 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2103  Integrase catalytic region  50.57 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5293  transposase (class III)  61.29 
 
 		 66 aa  87.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.923099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 382 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>