More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1700 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1747  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  96.3 
 
 
486 aa  851    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1700  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
486 aa  943    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282324  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.93 
 
 
481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.3 
 
 
481 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.47 
 
 
480 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.03 
 
 
480 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  41.18 
 
 
509 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  42.53 
 
 
511 aa  346  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
509 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  42.03 
 
 
511 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  41.62 
 
 
509 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.65 
 
 
513 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  40.77 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  40.73 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  40.77 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  42.24 
 
 
514 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  41.33 
 
 
509 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  41.33 
 
 
509 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  41.33 
 
 
509 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  41.53 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  41.53 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  43.23 
 
 
509 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  41.47 
 
 
532 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  44.3 
 
 
509 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  43.01 
 
 
509 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  41.97 
 
 
509 aa  332  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  40.82 
 
 
511 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  43.06 
 
 
509 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  45.3 
 
 
489 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.54 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
510 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.15 
 
 
505 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.76 
 
 
537 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  41.51 
 
 
510 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  42.56 
 
 
510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  42.49 
 
 
510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.45 
 
 
493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  41.72 
 
 
510 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  41.51 
 
 
510 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  41.51 
 
 
510 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  36.94 
 
 
541 aa  299  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  37.08 
 
 
541 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.11 
 
 
490 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.11 
 
 
507 aa  289  9e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  38.92 
 
 
496 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.19 
 
 
493 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.24 
 
 
532 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000163526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.6 
 
 
507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.44 
 
 
497 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  38.78 
 
 
577 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.03 
 
 
493 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  35.74 
 
 
502 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  35.49 
 
 
537 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  36.42 
 
 
503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  35.12 
 
 
489 aa  270  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  34.73 
 
 
534 aa  269  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.36 
 
 
513 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.83 
 
 
491 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  36.6 
 
 
515 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  35.54 
 
 
502 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  37 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.21 
 
 
503 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  37 
 
 
513 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  36.23 
 
 
512 aa  266  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  35.33 
 
 
502 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.34 
 
 
505 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  35.32 
 
 
521 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.74 
 
 
501 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.13 
 
 
519 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.09 
 
 
523 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  33 
 
 
522 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  36.6 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.52 
 
 
508 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  35.34 
 
 
501 aa  263  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  35.85 
 
 
494 aa  263  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.85 
 
 
494 aa  263  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.81 
 
 
535 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.02 
 
 
504 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.66 
 
 
496 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
514 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.05 
 
 
495 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  35.6 
 
 
504 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.52 
 
 
511 aa  257  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.88 
 
 
525 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.81 
 
 
504 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  37.35 
 
 
503 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.16 
 
 
517 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.88 
 
 
535 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  34.38 
 
 
502 aa  256  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  36.16 
 
 
496 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  36.16 
 
 
496 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  36.16 
 
 
496 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>