59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3691 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  38.06 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  29.9 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  29.69 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0671  transport-associated domain-containing protein  31.25 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.927155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  27.92 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  29.1 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  26.42 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  31.36 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  31.36 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  32.07 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  32.94 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  30.86 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  29.34 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  24.54 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  22.95 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  31.18 
 
 		 267 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  30.17 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  27.5 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  27.75 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  22.89 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  30.17 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  30.17 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  30.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  29.13 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  27.56 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  27.43 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  29.31 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  29.92 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  29.31 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  29.31 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  27.78 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  30.11 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  27.59 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  27.59 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0628  transport-associated  27.44 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  24.56 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  30.29 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  28.75 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  27.81 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  27.59 
 
 		 265 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  26.28 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  26.72 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  25.86 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  24.72 
 
 		 196 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  30.97 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  26.04 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  30.97 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4311  periplasmic phospholipid binding protein  28.57 
 
 		 264 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  30.97 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  30.97 
 
 		 182 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  23.83 
 
 		 284 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  30.97 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  24.08 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>