220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2141 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.7 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  43 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  42.67 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.38 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  43.28 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.58 
 
 		 287 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  44.05 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  41.97 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  41.73 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  41.38 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  40.37 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  41.3 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  41.5 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  40.94 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  40.94 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  39.75 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  40.15 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  39.78 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  36.97 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  37.58 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  40.33 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  39.38 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  39.38 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  39.38 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  39.02 
 
 		 296 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  39.33 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  39.26 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  38.74 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  37.99 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  37.85 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  32.43 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  35.36 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  32.23 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.56 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  31.89 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  32.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  32.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  32.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.23 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  32.92 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.89 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  31.89 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  35.4 
 
 		 267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.67 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.61 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  31.33 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.74 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.35 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  30.13 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.35 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  29.59 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.49 
 
 		 292 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  25.68 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  30.49 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.77 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.8 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.25 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  29.39 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  29 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  27.46 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.84 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  28.46 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  29.25 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>