28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5133 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  46.55 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  38.53 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  38.25 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  33.91 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  37.45 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  38.57 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  36.17 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  35.02 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  34.93 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  31.62 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  36.09 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  36.54 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  28.76 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  32.89 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  25.34 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  26.43 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  27.56 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  25.63 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  22.46 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.41 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  30.26 
 
 		 261 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.27 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>