150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1637 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 312 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  91.03 
 
 		 312 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  79.17 
 
 		 312 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  54.31 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  53.29 
 
 		 299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  51.68 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  51.68 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  51.33 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 399 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  51.13 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  50.67 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  50.51 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  50.96 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  50.96 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  50.33 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  50.5 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  47.71 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  47.52 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  48.83 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  35.15 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  30.77 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 		 305 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  27.96 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  27.96 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  31.34 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  28.03 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 276 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  28.18 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  29.27 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  27.15 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  25.19 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  28.15 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.89 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  26.62 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  26.48 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  26.41 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  23.26 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  24.18 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  22.58 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  23.53 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  23.79 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  26.71 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  31.41 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  30.13 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  24.64 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  28.36 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.64 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  24.63 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  29.94 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  27.65 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  26.25 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  24.92 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  29.07 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  25.59 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  22.58 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  21.5 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  26.92 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  29.49 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  30 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  22.26 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  22.35 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  24.82 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  22.92 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  26.94 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  23.6 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  27.02 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  24.55 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  28.66 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  27.58 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  27.59 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  23.22 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  28.82 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  25.32 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  27.36 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  27.2 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  26.78 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  24.15 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  24.68 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  25.41 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  26.98 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  23.3 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  29.55 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  25.52 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  27.05 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  29.1 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  23.66 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  31.72 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.72 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  27.08 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  28.36 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  28.36 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  28.36 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>