47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0616 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  328  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  83.54 
 
 		 166 aa  255  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  76.58 
 
 		 163 aa  244  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  78.81 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  91.13 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  66.88 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  76.22 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  70.92 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  62.18 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  63.46 
 
 		 188 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  60.4 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  63.57 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  48.8 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  45.7 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  52.41 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  47.65 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  59.31 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  47.68 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  38.16 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  47.59 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  35.42 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  36.03 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  37.14 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  37.14 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  31.3 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  31.3 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  29.51 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  29.38 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  29.5 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  31.71 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  27.97 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  26.95 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  29.05 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  28.69 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  28.16 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  27.07 
 
 		 154 aa  42  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>