38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4915 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  366  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  59.88 
 
 		 369 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  59.88 
 
 		 361 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  46.63 
 
 		 366 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 		 371 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 372 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 		 373 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 374 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  28.31 
 
 		 374 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  28.31 
 
 		 374 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  71.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.71 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.31 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  29.52 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 374 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  29.52 
 
 		 373 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.11 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  26.51 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  24.16 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  25.9 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 388 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>