57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1056 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 139 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.79 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.41 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.09 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.88 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.09 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.93 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.41 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.06 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.86 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.6 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.99 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.58 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.03 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.67 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.84 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  30.91 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.72 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.78 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.34 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.73 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.71 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.23 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.11 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.78 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.78 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.62 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.43 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  31.13 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1272  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1182  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0128557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.68 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.79 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 		 132 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>