24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2657 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  73.64 
 
 
782 aa  1106    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  100 
 
 
794 aa  1572    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  44.37 
 
 
764 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  31.69 
 
 
734 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
729 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.5 
 
 
680 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
718 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
680 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 
710 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
686 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  25.44 
 
 
678 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  27.1 
 
 
687 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  29.79 
 
 
725 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  29.43 
 
 
709 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  26.3 
 
 
699 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  27.78 
 
 
463 aa  55.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  26.69 
 
 
406 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
452 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2032  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.56 
 
 
482 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  23.56 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  24.94 
 
 
449 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0062  hypothetical membrane spanning protein  24.56 
 
 
482 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139951  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  38.27 
 
 
464 aa  45.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  22.83 
 
 
425 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>