41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0574 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  854    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.83 
 
 
408 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  33.8 
 
 
406 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  27.53 
 
 
419 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  29.3 
 
 
425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  28.87 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3946  hypothetical protein  27.49 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  27.54 
 
 
416 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5609  hypothetical protein  30.48 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0313  hypothetical protein  24.66 
 
 
438 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0094  hypothetical protein  25.25 
 
 
400 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0341  hypothetical protein  26.28 
 
 
417 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4609  hypothetical protein  27.65 
 
 
417 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4932  hypothetical protein  26.02 
 
 
417 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4917  hypothetical protein  26.02 
 
 
417 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3452  hypothetical protein  27.51 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  23.38 
 
 
678 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 
452 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  26.15 
 
 
463 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  21.9 
 
 
449 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  22.53 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  30 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  29.57 
 
 
764 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3730  hypothetical protein  26.97 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0234  hypothetical protein  25 
 
 
492 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25.91 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0383  hypothetical protein  27.27 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14321  hypothetical protein  23.03 
 
 
514 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  21.14 
 
 
685 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  20.45 
 
 
710 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  21.13 
 
 
441 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3502  hypothetical protein  28.57 
 
 
527 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.7799500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
692 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  28.03 
 
 
464 aa  46.6  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
686 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  23.38 
 
 
782 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0062  hypothetical membrane spanning protein  24.88 
 
 
482 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5551  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  23.84 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2032  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.88 
 
 
482 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>