53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0876 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
430 aa  855    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
452 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3730  hypothetical protein  29.86 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0386  hypothetical protein  29.43 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  26.58 
 
 
441 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  24.88 
 
 
428 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2936  hypothetical protein  24.52 
 
 
487 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000131529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  29.55 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0383  hypothetical protein  27.04 
 
 
500 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  27.66 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0296  hypothetical protein  25.3 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000491065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  33.63 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1401  hypothetical protein  31.22 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0100124  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5681  hypothetical protein  26.25 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5128  hypothetical protein  26.25 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.227701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5285  hypothetical protein  26.25 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5526  hypothetical protein  26.25 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0234  hypothetical protein  23.97 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4727  hypothetical protein  24.05 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  27.37 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  27.37 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0665  hypothetical protein  24.32 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000378366  hitchhiker  0.000000415551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
685 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5126  hypothetical protein  24.94 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5525  hypothetical protein  24.71 
 
 
483 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  25.81 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1560  hypothetical protein  25.74 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5110  membrane protein  26.96 
 
 
486 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0062  hypothetical membrane spanning protein  24.47 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139951  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2032  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.47 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  24.4 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.41 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  24.29 
 
 
463 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0787  hypothetical protein  22.45 
 
 
477 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00115123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0341  hypothetical protein  21.07 
 
 
417 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5398  hypothetical protein  24.93 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0396  hypothetical protein  22.22 
 
 
489 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  25.53 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
686 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4917  hypothetical protein  20.82 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4932  hypothetical protein  20.82 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4609  hypothetical protein  20.82 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  26.81 
 
 
699 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  25.97 
 
 
687 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  25.3 
 
 
710 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3452  hypothetical protein  21.39 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5109  hypothetical protein  20.6 
 
 
485 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2316  hypothetical protein  23.4 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.726194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  26.72 
 
 
764 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1941  hypothetical protein  21.12 
 
 
954 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000218078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2825  hypothetical protein  16.67 
 
 
942 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3709  hypothetical protein  23.12 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0516593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  24.81 
 
 
734 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>