41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0234 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0234  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  977    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0386  hypothetical protein  27.57 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2936  hypothetical protein  27.21 
 
 
487 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000131529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0665  hypothetical protein  25.82 
 
 
488 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000378366  hitchhiker  0.000000415551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5109  hypothetical protein  26.37 
 
 
485 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0383  hypothetical protein  25.43 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0296  hypothetical protein  25.45 
 
 
491 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000491065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5110  membrane protein  25.94 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5126  hypothetical protein  24.46 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1308  hypothetical protein  23.04 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5525  hypothetical protein  23.74 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5526  hypothetical protein  24.89 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5128  hypothetical protein  24.89 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.227701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5681  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5285  hypothetical protein  24.89 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0787  hypothetical protein  23.51 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00115123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  22.81 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2502  hypothetical protein  25.56 
 
 
513 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5553  hypothetical protein  24.61 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000443877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5104  permease  24.53 
 
 
437 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.479721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5402  hypothetical protein  22.47 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5121  permease  23.91 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5520  hypothetical protein  23.91 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1401  integral membrane protein  21.73 
 
 
493 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5277  hypothetical protein  23.91 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.606684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5674  hypothetical protein  23.91 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5605  hypothetical protein  22.46 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0166659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5549  hypothetical protein  23.27 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
430 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  32.65 
 
 
487 aa  51.2  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5218  hypothetical protein  23.98 
 
 
437 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  23.94 
 
 
428 aa  50.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  24.77 
 
 
678 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3942  hypothetical protein  21.46 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2087  hypothetical protein  25.95 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000957338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.66 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3730  hypothetical protein  26.06 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  25.13 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  20.15 
 
 
399 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>