37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0296 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0296  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  993    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000491065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2936  hypothetical protein  28.08 
 
 
487 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000131529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0383  hypothetical protein  26.97 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5128  hypothetical protein  26.22 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.227701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5681  hypothetical protein  26.47 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5526  hypothetical protein  26.22 
 
 
479 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5285  hypothetical protein  26.22 
 
 
479 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0386  hypothetical protein  30.7 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5110  membrane protein  26.56 
 
 
486 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0389  hypothetical protein  24.09 
 
 
403 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000244478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0665  hypothetical protein  28.01 
 
 
488 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000378366  hitchhiker  0.000000415551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0234  hypothetical protein  25.45 
 
 
492 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5126  hypothetical protein  23.19 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5525  hypothetical protein  23.64 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5109  hypothetical protein  21.71 
 
 
485 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0787  hypothetical protein  22.87 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00115123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0876  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000359561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1308  hypothetical protein  21.75 
 
 
476 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3730  hypothetical protein  25.63 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  29.3 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
610 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1056  hypothetical protein  25 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5104  permease  27.96 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.479721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5402  hypothetical protein  29.5 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1401  integral membrane protein  21.66 
 
 
493 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5553  hypothetical protein  28.14 
 
 
437 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000443877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5277  hypothetical protein  25.84 
 
 
437 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.606684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5520  hypothetical protein  25.84 
 
 
437 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5674  hypothetical protein  25.84 
 
 
437 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5549  hypothetical protein  29 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5121  permease  27.01 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3942  hypothetical protein  26.07 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5605  hypothetical protein  28.5 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0166659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  25.23 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5218  hypothetical protein  28.71 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3053  hypothetical protein  24.81 
 
 
419 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>