44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2221 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2221  band 7 protein  100 
 
 		 310 aa  633    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.814731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3370  band 7 protein  89.87 
 
 		 306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3763  band 7 protein  72.6 
 
 		 303 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.882094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  25.32 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  27.27 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  25.69 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.58 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  27.13 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  26.64 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  24.54 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.47 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  25.1 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  22.62 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  23.44 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.57 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  23.72 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  22.4 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  24.04 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  25.59 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  23.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  21.12 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  24.77 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  24.59 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  25.41 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  23.4 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.61 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  25.63 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  25.63 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  24.59 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  21.59 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  20.11 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  24.11 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  22.09 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  23.87 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  22.88 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.34 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  24.04 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  24.04 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.73 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  24.74 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.31 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  23.23 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  26.37 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  24.26 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>