45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0509 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0509  methyltransferase type 11  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  normal  0.940294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1262  methyltransferase type 11  90.09 
 
 
232 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 
299 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
201 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
285 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4974  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
284 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  42.22 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1111  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000134358  hitchhiker  0.0000106237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.37 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  31.71 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  40.74 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.84 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  31.18 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  30.3 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
527 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.16 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.73 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
279 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
269 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
531 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
246 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
527 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.71 
 
 
220 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>