117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4393 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  100 
 
 		 208 aa  413  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1317  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.33 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242931  hitchhiker  0.00262131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.13 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.68 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  33.33 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.72 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.13 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.25 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.4 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.72 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.81 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.14 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.47 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.88 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.51 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.78 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.91 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.3 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.05 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.11 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.12 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.91 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0165  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0170  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.54 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.33 
 
 		 267 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  29.2 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  37.8 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.27 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  26.36 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.67 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.97 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  30.91 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.53 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  28.29 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.63 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.63 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.63 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.97 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.67 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.91 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  32.97 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  41.67 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  32.21 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.65 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  29.53 
 
 		 275 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.53 
 
 		 254 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.53 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.3 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.57 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  39.02 
 
 		 636 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.2 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.2 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.2 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.2 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.32 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.93 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.9 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  37.35 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  28.67 
 
 		 832 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.18 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  21.33 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.63 
 
 		 284 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.35 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.11 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  23.72 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.17 
 
 		 297 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3064  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000163299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  28.7 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2337  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.55 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.7 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.15 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>