75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2337 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2337  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0165  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.87 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0170  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.87 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.56 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  27.78 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.19 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  28.77 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  31.3 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.44 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.93 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.09 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.11 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.32 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.01 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  25.45 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.14 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.72 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.87 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.67 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  33.67 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.19 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.3 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.45 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  25.15 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.28 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.37 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.78 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.86 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.42 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.05 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.13 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.17 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.01 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  29.41 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.6 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.17 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.17 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  27.17 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  25.53 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.81 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.75 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  27.55 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  24.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.31 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2680  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.51 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172799  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  24.86 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.55 
 
 		 378 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.3 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  24.85 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.75 
 
 		 249 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.34 
 
 		 237 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.75 
 
 		 249 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.58 
 
 		 227 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.05 
 
 		 303 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 		 233 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.65 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 		 282 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 		 295 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 264 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.42 
 
 		 230 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>