More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2055 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  54.9 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  50.51 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  53.06 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  49.02 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  51.02 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  51.69 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  48.86 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  54.22 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.73 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  42.42 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  42.42 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  49.4 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  49.4 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  48.31 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  54.55 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  45.78 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  46.99 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43 
 
 		 106 aa  87  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  53.41 
 
 		 115 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  50.6 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  48.19 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  48.81 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  48.19 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.34 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  52.7 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.75 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  43.18 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  47.56 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  52.54 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  43.84 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  42.05 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  41.03 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  38.54 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  39.53 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>