27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1637 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 800 aa  1645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.59 
 
 		 780 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.37 
 
 		 838 aa  229  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.41 
 
 		 717 aa  225  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.61 
 
 		 848 aa  217  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  28.71 
 
 		 812 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 		 735 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 830 aa  203  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.89 
 
 		 719 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.9 
 
 		 808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.4 
 
 		 755 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.51 
 
 		 808 aa  183  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.37 
 
 		 757 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  27.23 
 
 		 806 aa  173  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  25.04 
 
 		 799 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  32.59 
 
 		 850 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.08 
 
 		 737 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.95 
 
 		 845 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  33.12 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 837 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.38 
 
 		 810 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.18 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  33.5 
 
 		 762 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  38.01 
 
 		 761 aa  92.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  33.82 
 
 		 1032 aa  57  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.7 
 
 		 755 aa  44.3  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>