More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0601 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  69.49 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  71.43 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  65 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  67.86 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  69.64 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  55 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  64.41 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  69.81 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002334  SSU ribosomal protein S18p  68.63 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00021  30S ribosomal protein S18  68.63 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  62.96 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  61.82 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  59.26 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  66.04 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  66 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0417  ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  68.63 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  56.9 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  57.89 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>