42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5856 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  73.68 
 
 
138 aa  209  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  64.23 
 
 
137 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  66.41 
 
 
131 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  35.88 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  32.03 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  29.91 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  30.51 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.77 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  29.52 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  31.2 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  31.2 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  31.2 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  28.24 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.78 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.52 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  25.19 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  24.62 
 
 
1420 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  24.59 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.76 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  24.11 
 
 
287 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  29.6 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  26.77 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  25.38 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  25.35 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  29.82 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  23.58 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  24.22 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  25.78 
 
 
136 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  24.22 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  27.69 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  22.48 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  25.83 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  28 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>