More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4843 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  89.67 
 
 
426 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  100 
 
 
426 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  44.3 
 
 
435 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  41.16 
 
 
425 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  41.12 
 
 
422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  40.51 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  38.99 
 
 
447 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  40.93 
 
 
419 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  41.3 
 
 
415 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  40.1 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  39.84 
 
 
434 aa  266  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  33.16 
 
 
436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  27.78 
 
 
429 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  27.65 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  28.82 
 
 
428 aa  116  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  27.34 
 
 
415 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  27.5 
 
 
424 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  25.07 
 
 
449 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  26.18 
 
 
429 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  26.28 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2852  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  34.5 
 
 
229 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.26 
 
 
353 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  28.63 
 
 
361 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  28.63 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  28.81 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  28.81 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  28.81 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  28.81 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  28.81 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  28.63 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  28.63 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.98 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  26.87 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.25 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.8 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.8 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  21.98 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  25.54 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.97 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.87 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  26.45 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  28.11 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  24.43 
 
 
363 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  27.24 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.82 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.19 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  27.76 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.97 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.56 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  25.9 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  25.9 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  23.96 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  21.98 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  21.98 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  21.98 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  24.69 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  21.98 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  23.42 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  26.72 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  27.21 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  23.26 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.42 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  27.85 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.89 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  22.92 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  28.51 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  26.36 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  24.68 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  26.36 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  24.46 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  25.94 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  25.91 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0152  aminopeptidase P  26.88 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.15 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  21.45 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  29.18 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  26.61 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.31 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  26.28 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.03 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  23 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  24.39 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.31 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  23.24 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  25.1 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  27.11 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.03 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.46 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  25.65 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  25.1 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.69 
 
 
353 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>