66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0703 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
116 aa  233  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0648  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  94.83 
 
 
116 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966116  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3821  hypothetical protein  72.41 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5114  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.55 
 
 
118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1651  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.57 
 
 
115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00430685  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4261  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.03 
 
 
114 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.03 
 
 
114 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2346  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.37 
 
 
134 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0890791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3323  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.6 
 
 
115 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.27 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2857  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.49 
 
 
134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667667  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
461 aa  153  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2806  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.72 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2331  hypothetical protein  65.49 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000141879  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2462  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.04 
 
 
118 aa  150  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.230174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1988  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.79 
 
 
116 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0736398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1530  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.83 
 
 
115 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0387  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.21 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1839  hypothetical protein  65.49 
 
 
120 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1911  hypothetical protein  65.49 
 
 
120 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0627023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4263  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.49 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.49 
 
 
109 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0202  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.55 
 
 
109 aa  127  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2094  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.38 
 
 
128 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160626  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3716  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.62 
 
 
122 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  hitchhiker  0.00435102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1569  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.546229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0479  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
107 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3846  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
107 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3790  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
107 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3340  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
107 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3972  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
107 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0521  hypothetical protein  54.55 
 
 
107 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0519  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
107 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3512  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
107 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1303  hypothetical protein  52.04 
 
 
101 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000699788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2237  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4489  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.08 
 
 
224 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3981  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.92 
 
 
224 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00418291  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5002  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.92 
 
 
224 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2124  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.88 
 
 
224 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.69 
 
 
192 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0520  hypothetical protein  56.06 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4097  hypothetical protein  37.5 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0235678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3311  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  36.62 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3117  hypothetical protein  37.88 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30877  predicted protein  29.76 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216922  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0281  hypothetical protein  34.67 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0735  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.502281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2498  hypothetical protein  32.69 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3555  hypothetical protein  31.11 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1679  hypothetical protein  29.63 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000558133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2536  hypothetical protein  29.9 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00800306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1365  hypothetical protein  34.69 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1974  hypothetical protein  28.87 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2333  hypothetical protein  29.81 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0383076  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1664  hypothetical protein  28.57 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0176885  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 
105 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000547273  hitchhiker  0.0000000000361664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3374  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.85 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02020  hypothetical protein  30.86 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4720  hypothetical protein  46.15 
 
 
44 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
106 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>