54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0245 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0245  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00983479  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5484  hypothetical protein  54.4 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265246  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1715  hypothetical protein  55.06 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250535  normal  0.166877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0312  hypothetical protein  52.41 
 
 
192 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4043  hypothetical protein  46.11 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  45.81 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4256  hypothetical protein  44.57 
 
 
192 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  47.67 
 
 
196 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3478  hypothetical protein  45 
 
 
212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  43.33 
 
 
196 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  43.09 
 
 
204 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  41.11 
 
 
189 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  45.86 
 
 
199 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  41.11 
 
 
189 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  45.86 
 
 
194 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  39.44 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2639  hypothetical protein  46.24 
 
 
207 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3461  hypothetical protein  46.41 
 
 
199 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30578  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0916  hypothetical protein  50.77 
 
 
173 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12654  normal  0.0722419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2746  hypothetical protein  43.96 
 
 
206 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3304  hypothetical protein  43.72 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2209  hypothetical protein  38.3 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.92136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0232  hypothetical protein  44.13 
 
 
199 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3017  hypothetical protein  37.02 
 
 
191 aa  131  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2061  hypothetical protein  43.89 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496679  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3959  hypothetical protein  45.3 
 
 
194 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2961  hypothetical protein  41.62 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  38.6 
 
 
193 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2990  hypothetical protein  42.78 
 
 
200 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00506  conserved hypothetical protein  41.56 
 
 
315 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.848449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1383  hypothetical protein  46.84 
 
 
206 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  normal  0.0241422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14380  hypothetical protein  46.24 
 
 
190 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.647802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  37.1 
 
 
198 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  40.46 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  36.63 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0732  hypothetical protein  39.04 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4907  hypothetical protein  48.72 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  35.43 
 
 
194 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0604  hypothetical protein  41.67 
 
 
198 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  32.22 
 
 
196 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  32.22 
 
 
196 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1686  hypothetical protein  36 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0836  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  92.8  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0854  hypothetical protein  29.65 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3034  hypothetical protein  40.74 
 
 
126 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  31.79 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2699  hypothetical protein  33.54 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115069  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3925  hypothetical protein  39.25 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1957  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0583  hypothetical protein  38.61 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0494  hypothetical protein  34.58 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5239  hypothetical protein  33.7 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>