71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2879 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
203 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  63.68 
 
 
201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.3 
 
 
200 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  52.68 
 
 
205 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.47 
 
 
209 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
197 aa  202  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  52.02 
 
 
200 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.02 
 
 
200 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.74 
 
 
201 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.74 
 
 
201 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.74 
 
 
201 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.74 
 
 
201 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.74 
 
 
201 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  52.04 
 
 
198 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.23 
 
 
211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.5 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.45 
 
 
211 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.45 
 
 
211 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  61.64 
 
 
201 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.19 
 
 
201 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.56 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.24 
 
 
205 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.04 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.08 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
205 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.52 
 
 
201 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  43.52 
 
 
201 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.33 
 
 
201 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  43.52 
 
 
201 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.52 
 
 
201 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.56 
 
 
201 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  47.52 
 
 
201 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.45 
 
 
201 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.56 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  28.65 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
203 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.68 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.74 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.75 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.1 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.41 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.66 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.18 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.6 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.44 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.39 
 
 
246 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.1 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.35 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.79 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.36 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.47 
 
 
259 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.47 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.68 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.69 
 
 
259 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.15 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.03 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.91 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
248 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3070  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  25.15 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.34 
 
 
203 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
202 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.57 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  30.61 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.71 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>