49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2877 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  100 
 
 
447 aa  892    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  60.1 
 
 
437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  48.36 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  46 
 
 
445 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  45.58 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  48.37 
 
 
444 aa  325  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  48.43 
 
 
449 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  47.29 
 
 
437 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  42.96 
 
 
464 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  42.46 
 
 
471 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  42.46 
 
 
471 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  43.87 
 
 
468 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  43.16 
 
 
471 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  42.89 
 
 
467 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  44.12 
 
 
467 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  37.65 
 
 
439 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  37.65 
 
 
439 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  37.65 
 
 
439 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  40.61 
 
 
428 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  36.49 
 
 
438 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  36.18 
 
 
430 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  35.93 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  37.5 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  35.93 
 
 
430 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  35.93 
 
 
430 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  37.09 
 
 
430 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  36.98 
 
 
430 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  37 
 
 
430 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  36.71 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.1 
 
 
478 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  52.31 
 
 
132 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  33.66 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  29.96 
 
 
552 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.15 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  31.34 
 
 
540 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  29.21 
 
 
533 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  28.11 
 
 
563 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  28.11 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.83 
 
 
550 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  28.11 
 
 
563 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  28.11 
 
 
563 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.64 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  30.22 
 
 
565 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  30.22 
 
 
565 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30.11 
 
 
565 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00861  hypothetical protein  32.58 
 
 
220 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  27.33 
 
 
581 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.78 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.6 
 
 
217 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>