More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2633 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 454 aa  947    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  97.57 
 
 		 455 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  76.43 
 
 		 455 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  85.43 
 
 		 454 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  64.44 
 
 		 455 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  64.22 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  64 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  64.33 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  65.27 
 
 		 459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  65.27 
 
 		 459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  60.84 
 
 		 452 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  62.11 
 
 		 453 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  61.33 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  62.83 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  60.04 
 
 		 453 aa  554  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  54.33 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  48.78 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  50 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  49.23 
 
 		 483 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  48.32 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  48.99 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  48.35 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  44.59 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  48 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  47.8 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  47.87 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  47.67 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  45.78 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  48.13 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  46.46 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  46.53 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  46.53 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  46.53 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  46.68 
 
 		 464 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  42.41 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  42.86 
 
 		 470 aa  335  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  37.17 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  39.06 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  39.95 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  36.26 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  35.1 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  32.59 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  32.59 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  34.47 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  34.03 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  32.79 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  30.67 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  32.51 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  32.73 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  31.54 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.73 
 
 		 446 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  33.69 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  31.69 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  35.22 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  34.66 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  35.05 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  33.42 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  30.51 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  30.45 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  34.9 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  33.82 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.51 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  30.63 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  34.36 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.25 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  29.8 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 445 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  29.8 
 
 		 476 aa  189  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  30 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  28.82 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.81 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  30.25 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  32.89 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  32.89 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.9 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  32.29 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  32.89 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.07 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  31.18 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  31.95 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  34.1 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  31.69 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  32.09 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.11 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  28.6 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  30.87 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  28.6 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>