256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3919 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  74.6 
 
 		 252 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  72.22 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  72.62 
 
 		 252 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  72.22 
 
 		 252 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  71.43 
 
 		 252 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  69.05 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  67.73 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  71.43 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  63.2 
 
 		 253 aa  281  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  53.57 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  53.57 
 
 		 252 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  54.37 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  58.33 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  57.54 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  52.42 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  50.41 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  50.2 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  49.8 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  47.81 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  47.81 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  47.93 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  47.01 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  42.51 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  44.26 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  40.65 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  40.73 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  44.58 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  40.17 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  42.74 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  39.33 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  43.09 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  42.79 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  38.82 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  38.49 
 
 		 255 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.66 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.66 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  38.49 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  38.71 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  43.1 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  36.4 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  34.69 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.98 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  40.25 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  35.89 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  36.21 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  34.11 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  35.39 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  38.24 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  38.24 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  38.24 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  37.39 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  38.49 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.21 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  36.21 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  37.82 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  37.82 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  37.82 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  35.83 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  37.66 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  36.03 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  34.01 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.77 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  34.01 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  34.01 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  37.13 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  34.01 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  34.01 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  33.75 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  35.1 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  35.29 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  34.58 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  37.08 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  37.08 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  37.08 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  33.76 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  36.71 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  32.39 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  34.85 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  33.06 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  35.42 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  35.42 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  35.42 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  35.42 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>