More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6230 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
499 aa  1017    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  37.33 
 
 
486 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  35.76 
 
 
497 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  39.05 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  37.17 
 
 
488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  36.35 
 
 
494 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  35.21 
 
 
499 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  36.56 
 
 
475 aa  236  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  35.66 
 
 
497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.47 
 
 
486 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.77 
 
 
479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  36.23 
 
 
496 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  35.46 
 
 
489 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  35.29 
 
 
477 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.21 
 
 
473 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  35.85 
 
 
479 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.21 
 
 
473 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.21 
 
 
473 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  36.81 
 
 
475 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  37.55 
 
 
493 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  31.55 
 
 
483 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.12 
 
 
483 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  35.38 
 
 
497 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  36.59 
 
 
496 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.63 
 
 
526 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  35.92 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  35.28 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  35.01 
 
 
489 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  36.22 
 
 
480 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  35.39 
 
 
492 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  34.72 
 
 
506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  33.95 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  35.07 
 
 
567 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  34 
 
 
503 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  32.48 
 
 
474 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.47 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  33.66 
 
 
503 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  32.92 
 
 
492 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  32.02 
 
 
505 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  36.8 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 
503 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.75 
 
 
478 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.75 
 
 
478 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  32.64 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  33.86 
 
 
512 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  32.26 
 
 
518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.72 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
493 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 
486 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  30.9 
 
 
515 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.25 
 
 
544 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.63 
 
 
546 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 
481 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  32.26 
 
 
471 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  31.23 
 
 
506 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  34.89 
 
 
515 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  34.82 
 
 
529 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  32.64 
 
 
522 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
505 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.84 
 
 
553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.57 
 
 
968 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 
552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.88 
 
 
549 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
508 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 
509 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.45 
 
 
414 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
548 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
548 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28.6 
 
 
571 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  29.92 
 
 
519 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  31.62 
 
 
611 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.78 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 
511 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.29 
 
 
574 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 
548 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 
509 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.32 
 
 
546 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.75 
 
 
548 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.75 
 
 
548 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 
548 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 
548 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  30.52 
 
 
538 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.52 
 
 
538 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
550 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
550 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.94 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.12 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  28.13 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
574 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  30.02 
 
 
578 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 
518 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.94 
 
 
502 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.43 
 
 
506 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 
531 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 
522 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  27.55 
 
 
502 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.42 
 
 
541 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>