More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6082 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
343 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  55.98 
 
 
341 aa  341  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.24 
 
 
346 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.57 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.4 
 
 
346 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.91 
 
 
347 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 
347 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 
347 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.55 
 
 
348 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
348 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  45.24 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  46.42 
 
 
360 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.14 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
354 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.55 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.71 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
349 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
341 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 
341 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.21 
 
 
346 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.95 
 
 
353 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 
342 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
350 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.4 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
349 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.43 
 
 
344 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.15 
 
 
347 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
364 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
364 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
356 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
346 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.72 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.02 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.36 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
342 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.49 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
355 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
347 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
336 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.82 
 
 
342 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
344 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
344 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
344 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
341 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.99 
 
 
350 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
342 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
343 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.92 
 
 
342 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
356 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
328 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
347 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.57 
 
 
336 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
345 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
352 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
336 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
336 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 
348 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
350 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.94 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
347 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
349 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
348 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
344 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
344 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
342 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
343 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
342 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
338 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.08 
 
 
347 aa  142  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
344 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
342 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
351 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.62 
 
 
342 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
349 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
342 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>