26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2655 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  839    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  65.78 
 
 
414 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  40.89 
 
 
409 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  36.72 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  35.7 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  35.24 
 
 
423 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  35.24 
 
 
423 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  35.01 
 
 
423 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  35.25 
 
 
423 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  36.34 
 
 
434 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  36.28 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  33.26 
 
 
424 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  35.81 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  34.32 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  33.72 
 
 
437 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.79 
 
 
461 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  35.51 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  26.67 
 
 
534 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  27.83 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  31.25 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  38.03 
 
 
407 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  39.71 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  26.42 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  33.93 
 
 
573 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>