87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0432 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 327 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  73.03 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.61 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.69 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.32 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  53.12 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  53.54 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.47 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.47 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.18 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  52.75 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  52.75 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  52.75 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  52.75 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  52.75 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  52.6 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.85 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  51.88 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  53.09 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  51.01 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.43 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.14 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.94 
 
 		 340 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.72 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.84 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  45.09 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  41.64 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  43.56 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.51 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.33 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.25 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  39.06 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.43 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.67 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.49 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.89 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.75 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  38.28 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.93 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  54.62 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.38 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.54 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.47 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.44 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  33.13 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  33.86 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  33.02 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.97 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  32.7 
 
 		 270 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  34.89 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.16 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  31.68 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  33.44 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.03 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.7 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.15 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.64 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.2 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.97 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.25 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.5 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.67 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.58 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.27 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.12 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  29.6 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  27.64 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.65 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.54 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  32.86 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.91 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  26.52 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.73 
 
 		 272 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  26.17 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  33.97 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  24.61 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  26.3 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.3 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.9 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.42 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.97 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.76 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.72 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>