More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3099 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  53.47 
 
 
319 aa  318  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 
315 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
336 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
330 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
316 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  42.4 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  33.99 
 
 
334 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 
320 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
338 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  43.46 
 
 
296 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
663 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
287 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
300 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
336 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
295 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
330 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
358 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  40.31 
 
 
365 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  25.28 
 
 
308 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
376 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
280 aa  99  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
311 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
321 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  39.37 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
377 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
364 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  40.77 
 
 
373 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
313 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  31.58 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
294 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.76 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
370 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 
450 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
347 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.81 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  35.26 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
351 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
347 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  35.25 
 
 
255 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.13 
 
 
466 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  43.43 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.96 
 
 
377 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
367 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
350 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
623 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
398 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
581 aa  86.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
847 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
366 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
372 aa  86.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
746 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
930 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
898 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.3 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
703 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
1739 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
727 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>