27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3090 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3090  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 862 aa  1725    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2388  fibronectin, type III domain-containing protein  70.22 
 
 		 810 aa  1102    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.670329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  48.48 
 
 		 433 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  61.36 
 
 		 772 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  52.24 
 
 		 746 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  48.21 
 
 		 916 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  45.76 
 
 		 1281 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  63.16 
 
 		 431 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  65.12 
 
 		 2313 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  43.66 
 
 		 338 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  28 
 
 		 580 aa  48.1  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  34 
 
 		 2135 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.77 
 
 		 257 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  44.26 
 
 		 671 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  55 
 
 		 914 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 		 846 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1305  glycosyl transferase family protein  59.38 
 
 		 440 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  47.06 
 
 		 682 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  61.36 
 
 		 653 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  58.54 
 
 		 1034 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  52.5 
 
 		 430 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  51.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 201 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  56.82 
 
 		 476 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  35 
 
 		 983 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  59.02 
 
 		 830 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  58.14 
 
 		 584 aa  45.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>