21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0440 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1357    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  68.12 
 
 		 688 aa  802    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  30.32 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1099  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000342795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  33.58 
 
 		 687 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  31.75 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  32.56 
 
 		 768 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 686 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  26.39 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 475 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  30.33 
 
 		 655 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  30.39 
 
 		 523 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  29.9 
 
 		 510 aa  48.9  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  31.31 
 
 		 679 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  31.03 
 
 		 634 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  30.63 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  33.77 
 
 		 893 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2449  hypothetical protein  32.79 
 
 		 394 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  32 
 
 		 827 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  28.24 
 
 		 642 aa  43.9  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>