88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0554 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  100 
 
 		 323 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  78.5 
 
 		 335 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  77.64 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  77.64 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  76.78 
 
 		 320 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  76.78 
 
 		 320 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  76.16 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  70.81 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  73.21 
 
 		 320 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  64.29 
 
 		 324 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  64.65 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  57.78 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  57.1 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  55.87 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  54.75 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  54.75 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  54.75 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  54.75 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  55.41 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  55.41 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  56.6 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  50.47 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  48.4 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  55.09 
 
 		 273 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  46.82 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  41.94 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  43.87 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  43.73 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  44.41 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  33.53 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  30.92 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  30.62 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  39.26 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  42.54 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  36.9 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  34.81 
 
 		 143 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  32.68 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  34.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5227  chromate resistance signal  80.95 
 
 		 53 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  31.58 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  31.39 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  32.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  31.79 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  32.09 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  35.33 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  35.33 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  32.86 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  29.85 
 
 		 152 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  31.16 
 
 		 157 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.11 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  35.61 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 273 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  35.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  35.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  35.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  35.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  35.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  35.82 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  33.09 
 
 		 155 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  36.3 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  35.82 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  35.54 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  34.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  34.01 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  31.88 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  26.14 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  26.38 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  29.17 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  23.95 
 
 		 183 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  34.53 
 
 		 171 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  26.37 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  30.91 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>