40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1926 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  60.22 
 
 		 187 aa  230  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  58.24 
 
 		 183 aa  220  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  56.11 
 
 		 192 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  56.47 
 
 		 172 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5569  hypothetical protein  35.06 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  34.52 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3855  ChrB domain-containing protein  34.66 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0491  hypothetical protein  28.81 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  28.86 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  39.58 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  27.39 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  26.97 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  30.82 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  27.04 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  26.24 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  24.54 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  25.15 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  26.85 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  26.75 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  25 
 
 		 312 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  27.92 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  30 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  26.85 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  30 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  30 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  30 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  29.79 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  25.81 
 
 		 320 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  25.81 
 
 		 320 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  24.36 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  26.85 
 
 		 335 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  25.32 
 
 		 320 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  25.32 
 
 		 320 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  25.96 
 
 		 320 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  30.32 
 
 		 363 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  26.28 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  31.25 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>