40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0285 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  74.86 
 
 
192 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  69.06 
 
 
183 aa  264  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  70.35 
 
 
172 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  60.22 
 
 
196 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0491  hypothetical protein  35.26 
 
 
209 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5569  hypothetical protein  35.63 
 
 
181 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  36.78 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3855  ChrB domain-containing protein  37.14 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.36 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  28.57 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  27.98 
 
 
325 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  29.66 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  31.72 
 
 
316 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  30.29 
 
 
313 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  28 
 
 
313 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  34.04 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  35.42 
 
 
331 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  31.21 
 
 
312 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  35.42 
 
 
325 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  35.42 
 
 
325 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  35.42 
 
 
325 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  28.77 
 
 
320 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  26.39 
 
 
309 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  27.21 
 
 
320 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  26.54 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  27.21 
 
 
320 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  29.29 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  29.17 
 
 
323 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  24.24 
 
 
320 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  24.24 
 
 
320 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  25.47 
 
 
324 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  24.1 
 
 
324 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  28.72 
 
 
335 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  23.64 
 
 
320 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  28.06 
 
 
306 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  35.53 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  35.53 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  24.49 
 
 
333 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>