23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3855 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3855  ChrB domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5569  hypothetical protein  71.27 
 
 		 181 aa  268  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0491  hypothetical protein  54.49 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  37.14 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  37.14 
 
 		 187 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  38.01 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  36.21 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  34.66 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  27.61 
 
 		 324 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  28.17 
 
 		 320 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  28.17 
 
 		 320 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  29.27 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  29.27 
 
 		 320 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  29.36 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  30.93 
 
 		 328 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  26.28 
 
 		 320 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  25 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  25.69 
 
 		 312 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  26 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  25.26 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  23.6 
 
 		 320 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  27.39 
 
 		 335 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>