39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0096 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  313  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  43.64 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  30.9 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  39.58 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  40.51 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  27.61 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.32 
 
 
328 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  28.87 
 
 
332 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  26.54 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  34 
 
 
187 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  31.39 
 
 
325 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  43.28 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  32.61 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  34.95 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  34.95 
 
 
331 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  34.95 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  34.95 
 
 
325 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  28.47 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  27.46 
 
 
320 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  28.37 
 
 
320 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  28.37 
 
 
320 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  34.78 
 
 
323 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.58 
 
 
320 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.58 
 
 
320 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  24.14 
 
 
333 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  27.03 
 
 
363 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  31.33 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  35.71 
 
 
303 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  35.71 
 
 
303 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  31.03 
 
 
320 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  28.92 
 
 
320 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  35.38 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3855  ChrB domain-containing protein  26 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  35.82 
 
 
312 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  30.12 
 
 
324 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  34.34 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  31.25 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  39.34 
 
 
306 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5569  hypothetical protein  25.71 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>