35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1534 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  357  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  54.49 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  38.93 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.72 
 
 		 328 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  33.73 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  33.13 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  33.33 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  33.85 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  33.85 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  28.66 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  35.16 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.49 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  32.58 
 
 		 324 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  31.06 
 
 		 335 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  28.1 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  31.54 
 
 		 324 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  27.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  32.33 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  32.33 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  32.05 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  29.87 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  25.97 
 
 		 333 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  35 
 
 		 323 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  31.82 
 
 		 320 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  32.26 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  30.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  29.01 
 
 		 312 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0491  hypothetical protein  29.11 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  27.86 
 
 		 316 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  31.93 
 
 		 331 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  31.93 
 
 		 325 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>