33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2377 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  100 
 
 		 189 aa  357  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  68.59 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  65.8 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  59.86 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  63.43 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  53.9 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  50.34 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  45.86 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  41.92 
 
 		 238 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  46.1 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  46.1 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  42.68 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  51 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  32.33 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  34.03 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  35.07 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  34.03 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  71.05 
 
 		 50 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  34.82 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  28.04 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  31.62 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  33.08 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  39.84 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  33.59 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  37.84 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  29.91 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  28.14 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>