151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2348 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  84.6 
 
 		 410 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  85.16 
 
 		 410 aa  685    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  68.8 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  69.39 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  60.88 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  62.72 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  62.98 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  62.72 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  62.72 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  62.98 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  62.98 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  62.72 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  61.4 
 
 		 389 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  60.82 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  62.4 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  62.4 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  63.14 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  62.15 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  62.11 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  62.02 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  61.54 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  62.3 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  55.44 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  52.06 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  55.09 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  54.75 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  54.5 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  50.26 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  53.63 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  51.4 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  54.81 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  50 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  47.91 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  49.51 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  54.01 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  48.43 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  49.39 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  47.56 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  42.68 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  42.27 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  45.29 
 
 		 374 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  45.69 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  39.29 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  43.22 
 
 		 395 aa  298  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  44.47 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  42.82 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  43.19 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  41.56 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  42.15 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  41.27 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  44.5 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.16 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.43 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  42.05 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  44.08 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  42.78 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  38.16 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  38.19 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  41.79 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  42.23 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  44.93 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  41.46 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  40.98 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  40.33 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  42.41 
 
 		 375 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  36.36 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  41.46 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  43.25 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  44.69 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  43.18 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  43.58 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  39.59 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  42.39 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  41.62 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  42.68 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  41.88 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  41.94 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  41.79 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  41.1 
 
 		 403 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  37.78 
 
 		 386 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  38.97 
 
 		 445 aa  278  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  44.73 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  37.91 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  38.3 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  42.65 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  40 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  42.22 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  44.48 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  40.34 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  40.94 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  40.94 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  37.41 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  42.3 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  42.78 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  43.2 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  40.16 
 
 		 377 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  43.51 
 
 		 414 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  39.79 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  41.65 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>