206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2203 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2203  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  68.81 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2201  putative signal peptide protein  52.21 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2332  glycosyl transferase family protein  50.36 
 
 		 280 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1697  glycosyl transferase family protein  50.36 
 
 		 280 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2309  glycosyl transferase family protein  50.36 
 
 		 280 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  49.64 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2348  glycosyl transferase family protein  49.64 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2228  glycosyl transferase family protein  49.64 
 
 		 280 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 785 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 1162 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 1523 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 1268 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 1523 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.58 
 
 		 2401 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 		 1739 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 1340 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  24.13 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.24 
 
 		 1119 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 1435 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.45 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  26.79 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.83 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.69 
 
 		 610 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.57 
 
 		 1157 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25.62 
 
 		 723 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.84 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 994 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 1106 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  36.47 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  23.55 
 
 		 1837 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  21.61 
 
 		 892 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 742 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 742 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 352 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.65 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24 
 
 		 860 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 732 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 1032 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  25.63 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1674  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.112006  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 		 824 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>